На втория етаж на 300 кв.м. експозиционна площ в 4 зали, са разположени природните образци от живата и мъртвата природа на Източните Родопи. През 2002 г. със съвместен проект на Дружеството за защита на птиците в България и Швейцарска екологична фондация експозицията беше обновена. Живата природа е представена чрез хербарии на редки и защитени растения, билки, чрез фотоси са показани редките видове животни от Източните Родопи. Неживата природа е представена с колекциите на рудни минерали, нерудни суровини, геоди и скъпоценни камъни. Вкаменелостите на миди, охлюви, морски таралежи, корали и уникалната вкаменелост на риба - единствена в Югоизточна Европа, допълват богатата палитра от природни образци. Чрез цветни фотоси на природните забележителности - на "Каменната сватба", Вкаменената гора", "Счупената планина", "Дяволският мост" и др., публиката има удоволствието да се наслаждава на тази велика вълшебница - природата.